「あっという間の１年で、わくわくする成果や発見が出てきた」--スパコン『京』、医療応用で成果 : SIerブログ

1 ：ライトスタッフ◎φ ★ 2013/09/23(月) 10:31:33.35 ID:???
２８日に本格稼働から丸１年を迎えるスーパーコンピューター「京（けい）」（神戸市中央区）を
使い、病気の進行や治療効果の予測、薬剤を発見したり設計したりする過程「創薬」などを目指す
研究が加速している。心臓や血流の再現では既に世界最高水準を達成するなど、具体的な成果を
挙げつつある。

予測医療や創薬などの研究について、国は京を使って画期的な成果を目指す「戦略分野」の
一つと位置付ける。京は、神戸市が医療産業都市構想を進める神戸・ポートアイランドにあり
新薬開発などを目的とした企業や研究機関の進出も加速している。

■人体を丸ごと

京を使って「世界初」「世界最大」を連発するのは、「コンピューター上で人体を丸ごと再現
したい」と話す東京大大学院工学系研究科の高木周教授らのグループ。目標は、病気の進行の
早期予測や、それを基にした治療支援だ。

世界で初めて、心筋細胞内の分子の動きから、心臓全体の「拍動」までを一挙にシミュレー
ションすることに成功。赤血球や血小板などを含む血流全体、血管が詰まる血栓症も、世界で
最も詳細に再現した。赤血球が血管の中央に集まりやすい特性や、赤血球に邪魔されて血小板が
揺れ動く様子も表現している。

二つのシステムを連携させ、心筋梗塞のモデルも開発中という。病気の解明と薬の効果の判定
などに役立てることが期待できる。

このほか、１７億個の神経細胞が働く世界最大の脳神経シミュレーションに成功。その技術を
生かして、筋肉などの働きを加え、脳神経の異常で体の震えが出る「パーキンソン病」の解明も
視野に入れる。

■ウイルス

体外からの感染症も、人類の脅威だ。ウイルスの構造や働きを計算し、ワクチンや治療薬の
研究も進む。

名古屋大大学院工学研究科の岡崎進教授らのグループは小児まひウイルスや口蹄（こうてい）疫
ウイルス、神戸大などのグループはインフルエンザウイルスの研究にそれぞれ着手している。

物質が混み合った細胞内の状態を詳細に再現することには、理化学研究所（理研）の杉田有治
チームリーダーらのグループが、マイコプラズマという細菌をモデルに世界で初めて挑戦中で、
年内にも計算が終わる。病気の原因となるタンパク質の働きの正確な解明や、その働きを
抑える薬の開発につながる。今後、より複雑な動物細胞も再現したいという。

京を運営する理研計算科学研究機構の平尾公彦機構長は「あっという間の１年で、わくわくする
成果や発見が出てきた。今後も京を利用し、生命の仕組みを解明していきたい」と話す。

●参考/スーパーコンピューター「京」

◎http://www.kobe-np.co.jp/news/iryou/201309/0006361328.shtml
参照元：http://anago.2ch.net/test/read.cgi/bizplus/1379899893/

3 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 10:35:46.57 ID:edMUWO6G

社会経済の効率のよい運用についてのシミュレートも頼む。
一億人の仮想データの推移とか研究するのはスパコンなら容易だろ。

4 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 10:36:30.62 ID:wC+S5J9P

そーいやあ、昔、２ちゃんにウィルス解析だかゲノム解析だかに支援を
とかで、変なプログラムをバラマいてたけど
あれ、なんなの？
コンピューターに仕込んで協力してやったけど
スパムかなにか？

5 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 10:42:37.48 ID:edMUWO6G

>>4
宇宙からのノイズ解析なら俺も仕込んだ。
確かにハッキングの協力をしていたとしても分からんわな。

6 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 10:42:42.60 ID:4njjpTnG

外見が良かったのはクレイ-Ⅰだったな。

しかし「京」はでかいなあ。
もうそろそろ配線の伝達速度も問題になるのかな

7 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 10:46:25.03 ID:twhM4ByF

必死にアピールするけど大して役に立たないのが現実

9 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 10:47:38.79 ID:kAkWI+db

これ以上に長生きさせて増税しないでください。

11 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 10:54:17.41 ID:/ARMZWuW

産経は太鼓持ちに必死だな

17 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 11:16:49.42 ID:2qPXe0Yj

空冷はホコリを呼び込むから、空気を綺麗にして使ってるんだろうね

パソコンの調子が悪くなる何割かはホコリがたまって、湿度、温度が上がる時

18 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 11:19:06.24 ID:rmuDcCSy

費用対効果

21 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 11:36:43.65 ID:oUiQRh3N

京も全てを使わずに何分割かで使用してるから
なら1/10の性能のスパコンばら撒けばいいってのは
正論ではある。
無駄な付帯設備の建築費維持費でアホみたいな
費用かけて作ってるし。

22 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 11:37:52.31 ID:OjdGu9t4

二位のスパコンがもっと目覚しい成果を挙げたら大笑い。

24 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 11:41:40.80 ID:OjdGu9t4

サイズのでかいスパコンってズルじゃね？
同じ大きさので競えよ。

28 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 12:08:57.82 ID:X+FqMjy6

スパコンスレはかならずド素人の集まりになるな。ちなみに「京」の開発費の半分はソフト開発費だから

29 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 12:09:55.23 ID:6xiWZWKx

正直、「京」と「はやぶさ」は失敗だったと思ってる

30 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 12:10:45.90 ID:z7jLigCY

この手のひたすら計算しまくるプログラムは、ボトルネックになっている
部分のソフト最適化で、
簡単に1桁(10進数で)くらい速度アップするから
なぁ。

でもそういう話は一切ないんだよな。ハコモノに結びつかないから。(w

気象シミュレーションにしても、単に格子サイズを小さくしてデータ量を
増やしただけで、精度が向上したとか言ってるけど、ゲリラ豪雨の原因
となる積乱雲の発生に影響を与える高度方向の気流データや、気流の
流れる方向に影響する地形、夏場であれば河川や森林の水が蒸発すること
による上昇気流、都市部のビル風などは、プログラム上はまったく考慮
されていない。

単に格子サイズを小さくするソフト改修は、数行ほどの定数定義をちょっと
書き換えるだけで済む。

31 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 12:10:55.15 ID:TUVYSvAg

それよりやせる薬つくれや

33 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 12:14:15.28 ID:X+FqMjy6

スパコンはモンスターマシンを徹底して開発することだね。
1+1+1が3にならない世界だから

37 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 12:21:43.81 ID:wBl3TbRZ

あっという間に４位に落ちていたな。　開発費だけは今だに１位だけど。

52 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 13:29:51.02 ID:JWIY1/Dj

>>37
これまでの進化ペースだと、そろそろ桁が一つ進んでいておかしくないが
未だに京速をちょっと越えた程度のマシンが4位ってのは、そろそろ限界に近い証しなのかもしれない

53 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 13:42:01.70 ID:4bjag95m

>>52
エネルギー的な原因だと思う。
1ビット1秒間でオンオフするのに毎秒何ジュールいるのかな。
計算するために必要な電力で省電費なスパコンってないのかね

41 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 12:37:04.28 ID:RNhP7pMe

高木先生の研究グループも確かに凄いが、だからって何も新しいことは発見されてない。
赤血球の運動関係の話も全て１０年以上前にわかってる。

51 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 13:16:37.41 ID:AfFUso6o

京が本当に役立つなら、マッタク京と同仕様のコンピューター４，５基作れよ。
製造費は１基１割以下で済むだろ。
機能は世界１０位でも我慢するから沢山の問題解決するほうが御国の為だろう。

55 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 13:46:13.93 ID:or6IFgeB

うちがやってるカーボンナノチューブに銅を埋め込んで
電気関係いろいろ大幅アップ！

の、出番も近そうだな

56 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 13:47:36.16 ID:2x9oUnlW

日中尖閣攻防戦のシミュレーション頼みます

59 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 13:55:07.63 ID:MFBzEQvR

あるタイミングで突然0が3つ増えます的な進化は一度もしたことがないからね

60 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 14:02:25.28 ID:OjdGu9t4

量子コンピューターまだー？

61 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 14:04:11.07 ID:RpnWQ7av

スピードに驚く前に、恐ろしく時間のかかる計算式を作れるほうが感心する。
そんな世界にたずさわったことない

72 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 15:25:06.68 ID:RfiWIkby

シミュレーションが出来ましたというだけで
結局新薬が出来たとか新発見に貢献したとか
成果がでたわけじゃないからな
この手の不完全な再現で何か
新しい物が生まれるわけないことは
やってる人は当然分かってるんだろうけど
しょうも無いアピールばっかで萎えるわ

75 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 18:46:37.83 ID:Nj5W+CuY

レンフォーにはマジコンでも与えとけ

77 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 19:50:34.34 ID:z7jLigCY

無駄じゃなくて、単なる横領・遣い込みでしょ。

81 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 21:56:37.46 ID:z7jLigCY

必要とされているのは、研究費に見合う成果であって、一時的な性能ランキング
なぞに意味はない。

いくらピーク性能が高くても、結局のところ、実運用時にはタイムシェア
で使うので、たとえ性能が半分でランク外でも、コストが1/10で導入でき
れば、同じ予算で20台導入できるので、実性能では上回る。

時代遅れの大鑑巨砲主義とか、きょうび流行らんのですよ。

82 ：名刺は切らしておりまして 2013/09/23(月) 22:11:45.91 ID:F8+g3kjs

スパコンで1位、も悪くないけど、結局費用対効果を納税者によく説明できるかが重要ではないか。
「パソコン数万円だが、業務用最先端だからその1000倍くらいとしても数千万円で
超高級車1台分くらいかな」とかいう予算額ならそれほどとやかく言われないはずだ。

スポンサードリンク

コメント一覧

- 1. 名無し
- 2013年09月24日 12:17
- そういや、すぐに結果が出ないとかで予算削減やら「二位じゃ駄目なんですか！」とか、叫んでたアホな集団が与党だった時代があったなぁ・・・国民が馬鹿だと恐ろしい結果を招くという状況だった・・・むろん、オレはその党には票を入れなかったが・・・
- 2. 匿名さん
- 2013年09月24日 12:19
- マジコン議員のくだりまでは読んだ。
  
  つーか日本凄いわ
- 3. 名無し
- 2013年09月24日 12:55
- 米1
  お前はあのオバハンが言ったからむかついてるんだろうけど、実際、1位であることに何の意味もないわな。
  
  巨大な予算で一瞬1位になっても、それをベンチワークに100分の1の予算であっという間に中国が追いつくだけ。医療や宇宙工学だって、現時点での最高のマシンを使うわけでなく、実際の現場では5年10年前の機器が使われている。巨額予算で先頭を走る意義なんてどこにもない。NECに巨額予算をぶち込んで一瞬1位になっても、どこにも還元されない。
  
  ていうか、もう中国が1位になってるんだけど、どうせお前みたいなタイプは中国韓国に抜かれたら「1位なんて意味がない」とか言い出すわけだろ？
  
  もう全てが好き嫌いの感情だけ。
- 4.
- 2013年09月24日 12:57
- ソフトの改修は簡単には終わる。確かに終わるがこの手のものはそのあとのテスト工程があるからな
  お役所仕事だし手続きだけでかなり時間くいそう
- 5. あ
- 2013年09月24日 13:11
- へー凄いね
  でもどれだけ凄い物を見つけようと
  完治する薬は作らないんでしょ
  完治してしまえば金周り悪くなるもんね
  財〇省あたりが完治する薬の販売禁止にするんでしょ
  市販品も調剤も治る期待の持てない薬も中にはありますよね
  ただの小麦粉でさえも売れさえすれば良薬扱いでしょ
  風邪くらいなら元々気の持ちようと自然治癒で治る病気
  それでもみんなは薬を飲む
  一週間以上風邪が長引く場合は薬より滋養強壮剤を飲んで自然治癒力を高めよう
  あの馬鹿げた流れはなんなんだ
  初めから自然治癒力でいいじゃないかw
- 6. 名無し
- 2013年09月24日 13:33
- 宝くじで20億円間も無く当てる
- 7. 名無し
- 2013年09月24日 13:40
- シミュレートができるってことがどういう事かわかってないやつが多すぎる
  心筋の活動がシミュレートできたってことは
  現状心臓に異変のある人の原因がどこにあったかわかるのに
- 8. 名無し
- 2013年09月24日 13:45
- 調べてもよくわかんないんだけど、例えば京を1個置くのと、1/10規模の小さいのを10個置くのとじゃ、
  前者の方がコスト的に不利だったりするの？
  
  そうでもないならむしろ大艦巨砲主義にして巨大化＆集中化させたほうが効率いいんじゃ。
  1/10を10個じゃ、京と同じ計算はできないだろうし。
  
  むしろ各地に分散配置させるメリットって何。
- 9. 　
- 2013年09月24日 14:29
- ※3
  世界一のコンピュータを日本人が使用することに意味がある。
  中国人がそのコンピュータを作ったとでも思ってるのか？
  韓国人にそれが作れると思っているのか？
- 10. 名無し
- 2013年09月24日 14:57
- ネトウヨはアホだなあ・・・
- 11. 名無し
- 2013年09月24日 15:07
- 駄PGどものやっかみが酷い
  創薬に成功したらこいつら「僕は京ならやってくれると思ってました」なんて掌返すんだろうな
  
  ※8
  スパコン作るってことはデータセンタ建設するのと等価だから、京の1/10の規模でも10台作るとなれば10ヶ所データセンタが要るし無駄だらけだよな
- 12. 名無し
- 2013年09月24日 15:08
- ※3
  処理による。
  
  計算量のある処理をするとして、簡単に処理の10分割と結果結合ができるなら、小さいの10個の方が良い場合もあるかもしれない。
  でも、1台の方が良いって思うケースが多いと思う。
  
  使う側が目的果たすのにかかるコストが変わってくるから、一概にハードの値段だけじゃ話できないと思うよ。
  こういうのって、ソフトウエアの規模が0ひとつ増えたらかかる金は一桁どころじゃないから。
- 13. 名無し
- 2013年09月24日 15:40
- ハードウェアをゼロから全部作るから費用がかかるって聞いたことがあるね。
  単に計算させるだけなら、昔々大量のPowerMacにLinuxつんで並列作業させたら
  びっくりするほどの計算速度になったという話がある。
- 14. 名無し
- 2013年09月24日 16:11
- そう。だからやるならバイオインフォマティクス演算用の専用機作ってやれって。
- 15. 名無し
- 2013年09月24日 16:13
- ※11
  文科省予算でやってる限りパフォーマンス用だと思っていいよ。
  産業競争力があるなら経産省に移管になるはず。
- 16. 名無し
- 2013年09月24日 16:18
- ※3にあるけど、安く作れば問題ないんだよ、安く作ればね…
  ソフトにつぎ込める予算を圧迫することもないだろうし…
  研究に必要なのは安く長く使えることだからね…
  なぜコンピュータの研究と関係ない研究所が四苦八苦してン十万でスパコンを自作する方法を考えたりしてるのか、ちょっと考えてみたほうがいいよ
- 17. 　
- 2013年09月24日 17:45
- 李や朴に気を付けてね

戻る

このページは以下ＵＲＬのキャッシュです
http://sierblog.com/archives/1751631.html

SIerブログ